샹그릴라 해양 청정 보호구역은 리조트 전방의 해안가으로부터 5 헥타르에 해당하는 지역입니다. 2006년 11월 26일, 라푸라푸 시 규정 425-B-2006에 의거하여 라푸라푸 시의회에 의해 제정되었습니다.
리조트, Scotty's Action Sports Network 그리고 Amore Charities, Inc 로 구성된 샹그릴라 해양 청정 보호 그룹은 세부 막탄의 산호초 훼손을 방지하고 산호초를 보호하는 책임을 수행하고 있습니다.
또한 호텔 임직원 일동은 산호 복구 프로그램과 월례 해변 정화 프로그램에 참여하고 있습니다.